组合贷款会有两个放款通知。组合贷款是由商业贷款和公积金贷款组合而成，所以在申请贷款的时候等于是需要通过两个机构进行两道审核程序，所以会有两个机构通知放款。另外办理时间通常都会比较久，组合贷的放款时间一般是三个月。根据规定，组合贷款的借款时间和还款时间是一样的，因此不存在放款的先后顺序。
申请组合贷款，初审手续与公积金贷款相同。初审通过后，借款人到银行办理公积金贷款其它手续时，要按照银行要求填写商业贷款部分的借款申请表并办理有关手续。两部分贷款审批完成后，同时由银行拨付到售房单位帐户。在组合贷款中，公积金贷款和商业贷款的贷款期限、借款日期和还款日期都是相同的，只不过执行不同的利率。
组合贷款在还月供的时候是不能一起还款的，因为公积金贷款和商业贷款的还款方式是不一样的，因此在还款的时候会设置好两个账户进行还款。一个是商贷还款指定账户，另一个则是公积金还款账户。在还款日之前，用户只需要把资金分别存入两个账户之后，等到了还款日系统就会自动划扣。
值得一提的是，尽管组合贷款因为审批、放贷时间不同导致资金到账时间不一致，但是其每月的还款日仍然是同一天的。
在偿还组合贷款的过程中，如果想提前还清贷款，大多数借款人都会为了节省房贷利息，从而考虑先把利息较高的商业贷款还清。虽然组合贷款涉及到银行和公积金管理中心两个机构，但是如果打算提前还款，先还哪部分都是借款人自由选择的，因此可以先偿还公积金部分，也可以先偿还商业贷款部分。